丛生在根颈上，肉质，冬季在地下越冬，春初随气温上升，萌芽出土，初生时水红色至浅紫红色，也有黄色的，长出地面后，颜色加深，一般成为深紫红色，外有鳞片保护。芍药的芽为混合芽，既发育成生殖器官——花，又形成营养器官——茎和叶。萌芽前，芽长为2.5～4厘米。芽生出地面之后的颜色与形态也因品种不同会有所差异，颜色从深紫红色到黄褐色不等，芽形则可分为3型：即短圆型、竹笋型、笔尖型。短圆型，芽体较短，端部钝圆形；竹笋型，芽体较长，端部急尖，呈竹笋状；笔尖型，芽体较长，端部渐尖，状如毛笔的笔尖。芍药发芽是最壮观的场面之一，因为它体现了生命的萌发与活力，因此具有较高的欣赏价值。
由根部簇生，高约50～110厘米，草本，茎基部圆柱形，上端多棱角，有的扭曲，有的直伸，向阳部分多呈紫红晕。
叶，下部的二回三出羽状复叶，即叶的末端由3片小叶组成一束叶，两侧又各有一束叶，两侧的每一束叶通常情况下由4片小叶组成，中部的复叶，末端的3片小叶不变，两侧的小叶片数开始减少，由原先的4片逐渐减为3片、2片或1片，甚至消失，当消失时，末端只有3片小叶构成，这时叫做三回羽状复叶，上方的叶片是单叶。叶长20～24厘米，小叶有椭圆形、狭卵形、被针形等，叶端长而尖，全缘微波，叶缘密生白色骨质细齿，叶面有黄绿色、绿色和深绿色等，叶背多粉绿色，有毛或无毛。芍药的叶也具有观赏价值，“红灯烁烁绿盘龙”中“绿盘龙”就是对叶的赞美，因此也可作为观叶植物。
花芽，芍药的芽为混合芽，属地下芽类型，萌发后伸出地面既抽桂长叶，又展蕾开花。混合芽是多种原基的复合体，由顶端生长点、芽鳞、芽鳞腋内的腋芽原基、叶原基、叶原基腋内的腋芽尿原基、苞片原基、萼片原基、花瓣原基、雄蕊原基、雌蕊原基等组成。该芽称之为母代芽，而芽鳞和叶原基腋内的腋芽原基就是子代芽的原始体。叶原基腋内的及其腋芽原基不产生芽鳞为裸芽；而鳞片腋内的腋芽原基有芽鳞，形成鳞芽。春天鳞芽萌发，子代裸芽随母代混合芽的节间伸长而伸出地面，形成主干上的花枝或分枝；其子代鳞芽不露出地面。待秋后地上部分枯萎后，位于芍药根颈部最上端的子代鳞芽就成了“顶芽”。实际上芍药的顶芽只有一个，就是种子萌发后，实生苗的顶芽。次年，这子代鳞芽就萌发出土，伸枝、展叶、开花。所以，裸芽的生命周期为2年，而鳞芽的生命周期为3年。
芍药其地下鳞芽的腋芽约于8月出现，其顶端生长点由外向内逐渐产生芽鳞原基，到第二年5月，已形成4个芽鳞包被的生长点，6月下旬芽鳞分化完成。然后，顶端生长点开始产生叶原基，叶原基有多个指状突起，而芽鳞原基仅有1～3个。叶原基分化从8月上旬到9月上旬结束。
花蕾，形状有圆桃、平圆桃、扁圆桃、尖圆桃、长圆桃、尖桃、歪尖桃、长尖桃、扁桃等数种。外轮萼片5枚，叶状披针形，绿色，从下到上依次减小；内萼片3枚（不包括变种），绿色或黄绿色，有时夹有黄白条纹或紫红条纹，倒卵形、宽卵形、圆形、椭圆形或不规则形。
花，一般单独着生于茎的顶端或近顶端叶腋处，也有一些稀有品种，是2花或3花并出的。原种花白色，花径8～11厘米，花瓣5～13枚，倒卵形，雄蕊多数，花丝黄色，花盘浅杯状，包裹心皮基部，顶端钝圆，心皮3～5枚无毛或有毛，顶具喙；园艺品种花色丰富，有白、粉、红、紫、黄、绿、黑和复色等，花径10～30厘米，花瓣可达上百枚，有的品种甚至有880枚，花型多变。花期5～6月，果期8月。果实
蓇葖果，呈纺锤形、椭圆形、瓶形等；光滑，或有细茸毛，有小突尖。2～8枚离生，由单心皮构成，子房1室，内含种子5～7粒。具有药用价值。
黑色或黑褐色，种子大型，呈圆形、长圆形或尖圆形。
芍药传统的繁殖方法是用：分株、播种、扦插、压条等。其中以分株法最为易行，被广泛采用。播种法仅用于培育新品种、生产嫁接牡丹的砧木和药材生产。
分株法是芍药最常用的繁殖方法，芍药产区的苗木生产，基本采用此法繁殖。其优点有三：一是比播种法提早开花，播种苗4～5年开花，而分株苗隔年即可开花；二是分株操作简便易行，管理省工，利于广泛应用；三是可以保持原品种的优良性状。缺点是繁殖系数低，三年生的母株，只能分3～5个子株，很难适应和满足现代化大生产及不断飞速增长的国内外花卉市场的需要。
芍药的分株，理论上讲，从越冬芽充实时到土地封冻前均可进行。但适时分株栽植，地温尚高，有利于根系伤口的愈合，并可萌发新根，增强耐寒和耐旱的能力，为次年的萌芽生长奠定基础。不可过早分株，以免发生秋发现象，影响翌年的生长发育；亦不宜过迟分株，其时地温已不能满足芍药发根的需要，以致次年新株生长不良；若迟至春天分株栽植，芽萌发出土，因春季气温渐高、空气温度小，蒸腾量大，分株后根系受伤，不能正常吸收水分和养分，造成断株生长十分衰弱，甚至死亡，所以中国农谚有“春分分芍药，到老不开花”之说。芍药分株适期一般较牡丹为早，荷泽的农谚“七月芍药，八月牡丹（指农历月份）”，是说在菏泽，从8月底芍药就可以分株了，直至9月下旬（处暑至秋分）。而扬州在9月下旬到11月上旬分株。分株苗经三四年生长又可再次分株。年久不分，会因根系老朽，植株生长衰弱，开花不良。
分株时细心挖起肉质根，尽量减少伤根，挖起后，去除宿土，削去老硬腐朽处，用手或利刀顺自然缝隙处劈分一般每株可分3～5个子株，每子株带3～5个或2～3个芽；母株少而栽植任务大时，每子株也可带1～2芽，不过恢复生长要慢些，分株时粗根要予以保留。若土壤潮湿，芍药根脆易折，可先晾一天再分，分后稍加阴干，蘸以含有养分的泥浆即可栽植。在园林绿地中，芍药栽植多年，长势渐弱急待分栽，又不能因繁殖影响花期时游人观赏，可用就地分株的方法，用锹在芍药株旁挖一深穴，露出部分芍药根，然后，用利铲将芍药株切分，尽量减少对原株的震动，取出切分下来的部分，进行分株栽植，方法同上一般以切下原株的一半为宜。挖出的深穴，可加人适量肥料掺土压实。也可以用隔行分栽或隔株分栽的方法，这样，可在不影响景观的前提下，分株复壮，只是要连续分株2～3年而已。但是，因为芍药忌连作，隔行或隔株分栽的方法，不可连续应用，否则病虫害发生严重，生长不良，甚至死亡率大为增加。
芍药作药用栽培时，芍药产区多用芍头分株繁殖，秋天挖出母株，将粗根全部切下药用，而将带芽的芍头作为繁殖材料。首先去除无芽和病脚的芍头，将芍头切分成块状，每块带壮芽2～3个，芍头厚2厘米，过厚主根不壮，多分叉，过薄则养分不足。最好随切分，随栽植，若不能及时栽植，不要切分，芍头可沙藏备用。宜于8月上旬到9月下旬栽植。
栽植深度以芽入土2厘米左右为宜，过深不利于发芽，且容易引起烂根，叶片发黄，生长也不良，过浅则不利于开花，且易受冻害，甚至根茎头露出地面，夏季烈日暴晒，导致死亡。如果分株根丛较大（具3～5芽），第二年可能有花，但形小，不如摘除使植株生长良好。根从小的（2～3芽），第二年生长不良或不开花，一般要培养2～5年。
芍药的果实为蓇葖果，每个蓇葖含种子1～7粒。待种子成熟，蓇葖开裂，散出种子。各地果实成熟期不一，如黑龙江省牡丹江在9月上旬、山东荷泽在8月下旬、河南洛阳在8月上中旬、江苏扬州在8月下旬前后。种子宜采后即播，随播种时间延迟，种子含水量降低，发芽率下降。种子有上、下胚轴双重休眠特性，播种后秋天的土壤温度使种子的下胚轴解除休眠状态，胚根发育生根。当年生根情况愈好，则来年生长愈旺盛；若播种过迟，地温不能解除下胚轴休眠，不能生很，则第二年春天发芽率大大降低。秋天播种生根后，经过冬天长时间的低温，可解除上胚轴的休眠。翌年春天气温上升，湿度适宜时，胚芽出土。
当蓇葖果变黄时即可采收，过早种子不成热，过晚种皮变黑、变硬不易出苗。果实成熟有早有晚，要分批采收，果皮开裂散出种子，即可播种，切勿曝晒种子，使种皮变硬，影响出苗。如果不能及时播种，可行沙藏保湿处理，但必须于种子发根前取出播种。
芍药须当年采种即及时播种，如荷泽地区于8月下旬至9月下旬播种，若迟于9月下旬，则当年不能生根，次年春天发芽率会大大降低；而且，即使出苗，因幼苗根系不发达，难于抵抗春季的干旱，容易死亡。所以，荷泽几次进行春播试验，均告失败。
种子处理：播种前，要将待播的种子除去瘪粒和杂质，再用水选法去掉不充实的种子。芍药种子种皮虽较牡丹薄，较易吸水萌芽，但播种前若行种子处理，则发芽更加整齐，发芽率大为提高，常达80%以上。方法是用50℃温水浸种24小时，取出后即播。
整畦播种：播种育苗用地要施足底肥，深翻整平若土壤较为湿润适于播种，可直接做畦播种；若墒情较差，应充分灌水，然后再做畦播种。畦宽约50厘米，畦间距离30厘米，种子按行距6厘米、粒距3厘米点播；若种子充足，可行撤播，粒距不小于3厘米；播后用湿土覆盖，厚度约2厘米。每666.7平方米用种约50千克，撒播约100千克。播种后盖上地膜，于次年春天萌芽出土后撤去。也可行条播，条距40厘米，粒距3厘米，覆土5～6厘米；或行穴播，穴距20～30厘米，每穴放种子4～5粒，播后堆土10～20厘米，以利防寒保墒。于次年春天萌芽前耙平。
选地势较高、排水良好的圃地做扦插床，床土翻松后，铺15厘米厚的河沙，河沙要用0.5%的高锰酸钾消毒。扦插基质也可用蛭石或珍珠岩。在床上搭高1.5米的遮阳棚，据长春等地的经验，以7月中旬截取插穗扦插效果最好。插穗长10～15厘米。带两个节，上一个复叶，留少许叶片；下一个复叶，连叶柄剪去，用浓度为500×10～1000×10萘乙酸或吲哚乙酸溶液速蘸处理后扦插，插深约5厘米，间距以叶片不互相重叠为准。插后浇透水，再盖上塑料棚。据观察，基质温度28～30℃，湿度50%时生根效果最好。扦插棚内保持温度20～25℃，湿度80%～90%，则插后20～30天即可生根，并形成休眠芽。生根后，应减少喷水和浇水量，逐步揭去塑料棚和遮阳棚。扦插苗生长较慢，需在床上覆土越冬，翌年春天移至露地栽植。
利用芍药秋季分株时断根，截成5～10厘米的根段，插于深翻并平整好的沟中，沟深10～15厘米，上覆5～10厘米厚的细土，浇透水即可。
病虫害防治。
芍药病害主要有芍药灰霉病、芍药褐斑病?、芍药红斑病，芍药锈病。
芍药锈病：
该病只发现为害芍药，受害后叶部出现粉状斑，并促使地上部枯死，严重影响观赏和生长开花。该病的病原属真菌中的担子核辐射类，以菌丝或冬孢子堆在越冬寄主的病组织上越冬。第二年四至六月份冬孢子成熟，借风力传播到芍药上，五月上、中旬芍药开始发病，产生夏孢子堆，并以夏孢子重复侵染蔓延，后期形成冬孢子堆，冬孢子成熟后侵染松属植物，并于该植株上越冬。
虫害：
金龟子，
害虫种类与被害情况：危害芍药的金龟子有多种，如县黑绒鳃金龟子、苹果丽金龟子、黄毛鳃金龟子等，其成虫危害芍药叶片和花；幼虫蛴螬，虫体近圆筒形，弯曲成“C”字形，乳白色，头黄褐色，有胸足3对，无腹足。取食芍药根部，造成的伤口，又为镰刀菌的侵染创造了条件，导致根腐病的发生。
介壳虫：
介壳虫又名蚧。危害芍药的介壳虫有数种，如吹棉蚧、日本蜡蚧，长白盾蚧、桑白盾蚧、芍药圆蚧、矢尖盾蚧等。介壳虫吸食芍药的体液，使植株生长衰弱，枝叶变黄。发现个别枝被介壳虫危害时，可用软刷刷除，或剪去虫害枝烧毁，抓住卵的盛孵期喷药，刚孵出的虫体表面尚未披蜡，易被杀死。最好是加强检疫，严防引入带虫苗木。
蚜虫：
当春天芍药萌发后，即有蚜虫飞来危害，吸食叶片的汁液，使被害叶卷曲变黄，幼苗长大后，蚜虫常聚生于嫩梢、花梗、叶背等处，使花苗茎叶卷曲婆缩，以至全株枯萎死亡。喷洒40%乐果乳剂1000～1500倍液，或80%敌敌畏1500～2000倍液，或50%灭蚜松乳剂1000～1500倍液可以短期抑制蚜虫灾害。