后世称为“秘密战争”的最初起点，就来自于这座罗马地下城市拥有的一间地牢审讯室。
审讯人员在发现自己想要的东西之后，便依照自己拥有的权限自作主张对地牢里关押的斯库鲁人重新审问了一遍，果不其然发现了一些不得了的东西。小秘书直到被送上不朽之城的地牢入口时都还没弄明白这是怎么回事，不过她还是按照流程将这份报告牛皮纸封皮上盖着深红保密等级印章的文件交给了高等级情报分析员以及芬布尔之冬第一机密团的情报官。紧接着，原本只有值班人员的情报部门大楼窗口接连亮起了灯光，通讯卫星将呼叫请求送往了情报部门各级官员的通讯器里，居住大楼里陆陆续续走出了一批睡眼惺忪，穿着黑色制服的情报官员。
再然后小秘书就被送出了情报部门，她的表情依旧一头雾水不明所以。
她抱着文件走进了内政部门大楼，内政部大楼在一阵寂静之后也亮起了灯，各级别的电话相继被打通。直到禁卫军康斯坦丁接起了电话，这个联系呼叫网络才总算告一段落。禁卫军康斯坦丁沉默着站在黑暗的办公楼中，手捧平板电脑浏览着电子档的审讯报告。一份来自芬布尔之冬第一机密团、一份来自情报部门、一份来自审讯部门，只有三份报告完全一致才是可信的报告——这份报告帮助不朽之城理清了卡罗尔·丹弗斯带领斯库鲁人离开地球之后发生的事。正如之前所预料的那样，没有任何一个具有高等文明的外星种族愿意接纳斯库鲁人，哪怕是只能在自己所在的恒星系内航行殖民的文明，也多多少少听过斯库鲁人的大名。
所以在一个相当尴尬的时间点，卡罗尔·丹弗斯又把那艘装载着斯库鲁人的克里人轨道空间站给推了回来，并且承诺一定会帮助斯库鲁人寻找到新家园。那个时候，轨道空间站上的斯库鲁小孩都已经成年，新生一代对于寻找新家园的期望远没有老一辈那么强烈。
时任神盾局局长的尼克·弗瑞立刻察觉到了卡罗尔·丹弗斯的潜台词，他也是在那个时候有了建立以斯库鲁人为核心员工的天剑局的打算，他判断斯库鲁人寻找新家园的过程绝对不会那么顺利，而事实也确实如此。
鉴于卡罗尔·丹弗斯第一次返回地球的经历，尼克·弗瑞认为能与斯库鲁人达成一定的合作关系。然而就像他是个习惯性隐藏秘密的人，斯库鲁人也隐藏了秘密——有部分新生的斯库鲁人认为，没有必要舍近求远寻找新家园，无论是远古神话还是现实都表明眼前这个不起眼的星球就是斯库鲁人最好的殖民地。这种危险的思潮在卡罗尔·丹弗斯的失败之后广为扩散，但管理整个斯库鲁人群里的还是尼克·弗瑞当年的老朋友，因此还能规范年轻斯库鲁人的行动，一点民粹主义的思潮还不算什么大事。
直到多年前那个顶替尼克·弗瑞的斯库鲁人被萨洛蒙杀死，整个斯库鲁人族群这才有了反应。包含了复仇、殖民等思想的思潮逐渐占据上风，再加上尼克·弗瑞并没能正在加入到斯库鲁人的管理当中，也就导致了许多新生代斯库鲁人借口长期任务常驻地球，其中有些斯库鲁人更是干脆抛下了明面上的任务，自由自在地融入了人类社会。为了不让尼克·弗瑞起疑，对斯库鲁人失去信任，那些负责管理的斯库鲁人还必须为这些年轻斯库鲁人的行为进行遮掩。
根据维多利亚·汉德汇总的情报，尼克·弗瑞知道这件事，但却忽视了斯库鲁人新生代的力量与规模。就和他小看了神盾局内部异常情况一样，如果事情这么继续发展下去，那么与九头蛇叛乱类似的斯库鲁人叛乱是迟早会发生。维多利亚·汉德在拿到情报之后就与禁卫军进行了沟通，确定了接下来的行动方针。
这是一场你死我活的暗中战争，不朽之城必须获得胜利。
“加强审讯力度，弄清楚所有细节。”禁卫军直接向审讯者下达了指令，“不要担心伤亡，这些异形的生命就是为了提供情报。挖出它们的眼睛，斩断它们的四肢，让他们品尝到人类的恐怖。”
“吾主的想法呢？”维多利亚·汉德问道。
“我即是君主之手，我的权威来自于祂。”康斯坦丁平静地说道，“执行命令，动员芬布尔之冬第一机密团所有还能动员的人手，我会亲自带队执行任务。”
秘密战争第一阶段·前二十天
尼克·弗瑞被紧急从地牢里提取出来，维多利亚·汉德没有像往常一样对着老上司大费口舌，试图通过言语进行劝导，而是直接将那份情报拍在审讯桌上。
“你酿出的苦果不止九头蛇。”汉德特工瞥了眼脸色越来越难看的尼克·弗瑞，“解决它，要不然我们所有人都会死。”
秘密战争第一阶段·前十八天
将装甲车伪装成纽约SwAt的芬布尔之冬第一机密团正在对一座公寓进行破门。
在行动之前，不朽之城已经对周边地区的网络进行了控制，无论是电话还是互联网都不可使用。不仅如此，深埋在不朽之城地下的人工智能更是对附近所有摄像头都进行了控制，附近巡逻的警察在伪造的电台信息的指示下远离了这片区域，确保不会有任何关于此次行动的情报被无关人员获取。
毫不知情的女人尖叫着抗议警方的暴力执法，然后就被士兵拖离了现场，房屋的男主人则在两位穿着黑色防弹护甲士兵的挟持下跪倒在地。为首的士兵对着那个男人说了些什么，在得到自己想要的信息之后，士兵拿出挂在大腿上的手枪对着男人的脑袋扣动扳机。这场可以被称为处决的行为彻底暴露了男人的真面目，属于人类的皮肤开始萎缩，头发慢慢缩了回去，光秃秃的头顶上开始显露出油腻的绿色皮肤以及淡红色条纹，耳朵也开始变尖，像是故事中的精灵耳朵。士兵们立刻将尸体搬回装甲车，然后将酸液倾倒在斯库鲁人留下的血液上，整个过程不超过三分钟。
这是他们今天处决的第五位隐藏在纽约的斯库鲁人。
与此同时，接收到信息的另一批士兵则驱车前往纽约市郊的一处仓库。他们携带了爆破设备与拆除设备，打算对仓库的混凝土地面进行破除。几个小时后，一具完整的人类遗骸被发现，经过现场法医的快速鉴定以及现场遗留的物证，这是一具人类男性遗骸，应该是那位被伪装的房屋男主人。当士兵驱车离开之后，人工智能匿名拨通了纽约市警局的电话，将仓库里存在遗骸的情况告知警方。另一边正在安抚女主人情绪的警察也接到了通报，他们立即将女主人接到第八分局，要求她帮助辨认物证。
“纽约的斯库鲁人只有五人？”萨洛蒙摸了摸下巴，“比我想象的要少，我还以为斯库鲁人大多喜欢住在大城市。”
维多利亚·汉德对君主的题外话置若罔闻。“我们通过这些伪装成人类的斯库鲁人的通讯记录追踪到了更多的斯库鲁人。”情报部门主管面色严肃，“但是现在我们的行动效率太过低下。为了确保外星人不会挟持人类作为人质，我们的行动时机十分苛刻。”