一平看着小智和甲贺忍蛙，惊讶道：“这场对战时我输了，但是刚才的那个状态......头领！”
半藏点了点头道：“一平，带小智去祠堂吧！”
一平道：“是！”
一平带着小智去了祠堂，二平和三平则带着希特隆他们在村子里观光。忍者村的祠堂在地下，小智走进其中就看到了祠堂中供奉的三幅画像，一幅是勇士雄鹰，一幅是食蚁炉，最中间的那幅是甲贺忍蛙，但姿态与小智般甲贺忍蛙的形象几乎一样。
一平介绍道：“据记载，很久以前村子里忍者与忍者之间相互战斗是常规，那个时候挺身战斗保护村子的就是这三只宝可梦，而这三只宝可梦的领导着就是中间的那只甲贺忍蛙。其实我也是因为这样才选择呱呱泡蛙当伙伴的。小智先生，相信你也看出来了，英雄甲贺忍蛙和你的甲贺忍蛙的外形很像。”
小智道：“或许我的甲贺忍蛙就是英雄的后代吧！”
忽然间，天空中出现了许多只得盔甲鸟，它们齐齐使用了加农光炮进行扫射，似乎要将忍者村夷为平地。
地下祠堂中的小智和一平也听到了报警装置响起的声音，小智道：“敌袭？”
一平道：“应该是了！我去看看，小智先生你去找三平保护头领。”
小智道：“小心点！”
小智找到三平和希特隆他们并不难，莎莉娜问道：“小智，外面发生了什么事？”
小智道：“盔甲鸟袭击了村子！三平你们大家先去半藏先生那里！”
三平道：“我知道了，跟我来！大家往这边走！”
小智带着皮卡丘来到了外面，十万伏特挡下了加农光炮，小智道：“没事吧！大家不要惊慌。一平疏散大家去避难，这里就交给我了！”
二平带着妙蛙花站在了小智的身边道：“大哥，我留下帮小智先生！”
一平道：“你们小心！”
小智道：“这群盔甲鸟训练有素，不是野生的宝可梦，像是先头部队来扰乱我们的。那就速战速决，达克莱伊使用黑洞！”
达克莱伊出手，空中的几只盔甲鸟瞬间就被放倒，一只只直直坠落了下来。
但袭击忍者村的人真正的目标是忍者村的首领半藏！
三平和希特隆他们来到半藏的房间没过几分钟，一股刺骨的寒意朝众人袭来。三平挡在了莎莉娜和柚丽嘉的前面。一个戴着双斧战龙面具的男人出现在门口，他的身后的几人也戴着宝可梦的面具。
男人道：“忍者村的头领半藏，我们是前来要你本人的！”说着他身后的两人一跃而起，往地上扔了东西，瞬间黑雾就遍布了房间，众人的视线都被模糊了。
男人的阿利多斯趁机用吐丝将半藏捆了个严严实实，半藏老爷子没有任何反抗就被带走了。希特隆和莎莉娜派出了宝可梦前去追击，长尾火狐和伦琴猫被一只劈斩司令拦下了，才藏带着龟足巨铠支援下的情况下，最终还失去了这群人的踪迹。
一平和小智追到这里的时候，那群人已经完全不知道往哪个方向跑了。
三平道：“一平哥怎么办？头领被人带走了！”
小智都说了让他们保护好头领，他却还是被人带走了，三平对此很是自责。
一平道：“我派人去找！”一平吩咐了二平和三平先留在了村子里安抚村民们，自己带着人去找，只是什么都没有找到，这群人似乎很熟悉忍者村的路线。
夜晚，众人围在一起商量怎么去救半藏。才藏道：“带走头领的应该是景友！要不然不可能会这么熟悉村子里的路线。”
一平道：“我记得他，他曾经也是一个很优秀的忍者！我们要救出头领很难！”
景友曾经是忍者村中最优秀的忍者，本来他可以顺理成章的接下头领的位置的，但后来因为理念不合他背弃忍者成规，带着手下离开了忍者村，组成了忍者军团。
才藏就是为了调查从这件事所以才这么晚才回忍者村。
三平道：“他将头领带走会不会对头领做出什么事情啊！我们不能在这里坐以待毙！”
小智道：“这个叫景友的人，抓走了半藏先生是为了忍者村首领的位置，在达到目的前半藏先生是不会有事的。我像他一定会让半藏先生当着所有人的面亲口将头领的位置交给他。三平我记得你说过，一平在明天的祭典中半藏先生会宣布将忍者村头领的位置交给他对吧？”
一平道：“小智先生你的意思是，如果明天头领亲口承认了景友的头领身份，那么村民们即使不服，但身为忍者的我们也必须服从命令，要是战斗的话就会成为以下犯上，景友的地位就彻底坐实了！那我们今天就必须救回头领！”
这时村子里去探查的忍者回来禀报，在忍者村附近的大鹏山的山顶找到了景友他们的踪迹。大鹏山的地势很险峻也很陡峭，极难攀爬，忍者们的身手矫健对他们而言也不是什么难事，希特隆三人在达克莱伊的精神强念帮助下是最省力就达到山顶的。
一平道：“果然是你兵太夫！”
兵太夫道：“我不能让你们通过这里！”
跟在兵太夫身后的忍者军团的众人也一同放出了宝可梦，多是幽灵系、毒系和恶系得宝可梦，很是训练有素的样子。
三平道：“一平哥、才藏师父、小智你们去救头领，这里交给我了！”
希特隆和莎莉娜道：“还有我们！”希特隆和莎莉娜派出了伦琴猫和长尾火狐与三平的甲贺忍蛙联手攻击。
二平道：“别忘记还有我，出来吧，妙蛙花！”
“飞叶快刀！”
“高速星星！”
“喷射火焰！”
“水手里剑！”
这里的战场显然已经发展成了一场混战，小智相信希特隆他们的能力，所以就没有出手。
山顶上，景友的玛狃拉和一平的甲贺忍蛙也开始了对战，玛狃拉的实力高于甲贺忍蛙，甲贺忍蛙一直就处于下风找不到反击的机会。在玛狃拉使用合金爪的时候，甲贺忍蛙终于找到了反击的机会，使用了影子分身迷惑对手，玛狃拉使用了超级冲击来击碎影子分身。
但是甲贺忍蛙的真身在地下，破土而出的使用了水手里剑将玛狃拉击败！
甲贺忍蛙来到了半藏的身后用一字斩将绳索切断，一平道：“已经分出胜负了！”
景友叹了口气松开了握成拳的手，道：“难道......我真的输了吗？”
作为忍者村的首领这么简单就被人抓走，殊不知也是给一平的一个考验，现在这个考验也通过了。
半藏道：“一平拥有一个你完全没有东西，那就是‘献身’！为了所有村民的梦想并为了村子里所有宝可梦的未来而战斗，正因为如此他不会放弃，他相信自己相信甲贺忍蛙，一路战斗到最后一刻！”
至于最后忍者村会怎么处理景友和他的忍者军团就不归小智管了！第二天的庆典照常举办，半藏将代表头领的象征交给了一平。
参加完祭典，小智一行人继续踏上了前往映雪市的路。