惠芝郡主成功帮助王爷摆脱困境后，京城迎来了一段短暂的平静时光。然而，这份平静并未持续太久。
在一个宁静的夜晚，惠芝郡主突然收到一封神秘的信件。信中提到，在京城郊外的一座偏僻古寺中，有一位病重的高僧，他知晓惠芝郡主的身世秘密，希望郡主能前往一见。
惠芝郡主心中充满了疑惑和好奇，决定前往古寺一探究竟。她将此事告知了师傅神医侠女和娇兰，娇兰担心有诈，想要一同前往，但惠芝郡主深知此行可能危险重重，不愿让她们涉险，最终独自踏上了行程。
到达古寺后，惠芝郡主见到了那位病重的高僧。高僧面容憔悴，却透露出一股超凡脱俗的气质。他缓缓向郡主讲述了一个令人震惊的秘密：原来，惠芝郡主并非王府的亲生女儿，而是当年一场宫廷阴谋的受害者。她真正的身份是一位忠臣之后，因遭奸人陷害，家族蒙难，她被偷偷送出，阴差阳错地被王府收养。
惠芝郡主听完，如遭雷击，内心陷入了极度的混乱和痛苦之中。她不知道该如何面对这个突如其来的真相，更不知道自己的未来该何去何从。
在回府的路上，惠芝郡主神情恍惚，思绪万千。她想起了在王府中与王爷不亲近的过往，想起了自己治病救人的初心，心中充满了迷茫和挣扎。
回到王府，惠芝郡主将自己关在房间里，数日不出。神医侠女和娇兰心急如焚，却又不知如何劝慰。
与此同时，京城中又传出了一则惊人的消息：皇帝身患重病，宫中的御医们束手无策。朝廷下令在民间寻找名医，为皇帝诊治。
惠芝郡主得知此事后，心中五味杂陈。一方面，她对自己的身世感到迷茫和痛苦；另一方面，作为一名医者，她又无法坐视皇帝的病情不管。
经过一番内心的挣扎，惠芝郡主最终决定挺身而出。她带着师傅神医侠女和娇兰一同进宫，为皇帝诊治。
在宫中，惠芝郡主面临着各方势力的猜忌和刁难。一些心怀叵测的大臣们认为她是别有用心，企图借此机会谋取权力。然而，惠芝郡主不为所动，全心全意地为皇帝诊断病情。
经过仔细的诊断，惠芝郡主发现皇帝的病并非普通病症，而是中了一种罕见的慢性毒药。这种毒药极为隐秘，很难察觉。
为了找到解毒的方法，惠芝郡主和神医侠女日夜研究，查阅了无数的医书古籍。娇兰则在宫中四处打探消息，寻找可能的线索。
经过数日的努力，她们终于找到了解毒的关键。然而，此时宫中的局势却变得更加复杂。那些下毒的幕后黑手们察觉到惠芝郡主的行动，开始暗中策划阴谋，企图阻止她们为皇帝解毒。
在一个深夜，惠芝郡主和娇兰在前往药房取药的途中，遭遇了刺客的袭击。娇兰奋力抵抗，与刺客展开了一场生死搏斗。惠芝郡主则趁乱逃脱，前去寻找师傅神医侠女的帮助。
神医侠女得知情况后，迅速赶到现场，与娇兰一起击退了刺客。然而，她们也因此受了伤。
尽管如此，惠芝郡主并没有放弃。她深知自己肩负着重大的责任，不仅是为了皇帝的安危，更是为了整个国家的稳定。
在接下来的日子里，惠芝郡主和师傅、娇兰更加小心谨慎。她们在宫中步步为营，与那些阴谋势力展开了一场惊心动魄的较量。
最终，惠芝郡主成功地为皇帝解了毒。皇帝康复后，对惠芝郡主的医术和忠诚赞赏有加，赐予了她丰厚的赏赐。
然而，惠芝郡主却婉拒了皇帝的赏赐。她表示，自己所做的一切并非为了功名利禄，而是出于医者的本心和对国家的责任。
经历了这一系列的波折，惠芝郡主也逐渐放下了身世带来的困扰。她明白了，无论自己的身世如何，她都可以用自己的医术和善良，为人们带来希望和救赎。