钢铁岛上，钢系神奇宝贝们突然发生异变，开始四处大闹，接到正在岛上特训的阿驯通知。急忙赶去的真嗣一行人遇到了波导使者亚玄。
另一方面，阿驯和新生火箭队的班纳伊，在岛上遇到了正在发掘神秘遗迹的银河队，岛上的异变已然愈演愈烈。
“路卡利欧！”亚玄脸色难看的看着已经处在失控边缘的路卡利欧。
轰～！路卡利欧一发失控的波导弹射向真嗣一行人，
“波导之力，存于我心！”亚玄第一时间挡在几人身前，右手挥出，一道半圆形的蓝色光罩瞬间将众人保护起来，挡住了路卡利欧的波导弹！
“这个也是波导？！”小智惊讶不已。
“波导防护罩！”真嗣眼中亮光闪过。这个还真好用！
“没想到亚玄先生也能使用波导。”小刚感叹。
“我可是这一代的波导使者啊。”亚玄自嘲的笑了笑。
“路卡利欧，振作一点！”看着自己的路卡利欧痛苦的抱着头哀嚎，真嗣又急又感动。
同样被瓦解了波导外衣，真嗣的路卡利欧硬是用头撞击地面，也没有对真嗣出手。
“可是，路卡利欧的波导外衣呢？不是能保护自己吗？”小光疑惑的问，
“从整个遗迹爆发出来的力量，威力恐怕远超路卡利欧的防御了。”亚玄面色难看的说道。
“没错，几乎是一瞬间，两只路卡利欧的波导就被消除掉了。”真嗣点点头，直接把路卡利欧收回了宝贝球。
“唔啊！！”亚玄的路卡利欧还在痛苦的大闹，甚至挥舞骨集一气，想要攻击亚玄。
“波导之力，存于我心！”真嗣有样学样挡在前方，一手调动波导之力挥出。
嗡～一面蓝色光盾出现在真嗣身前，只不过并没有亚玄的防护罩覆盖的那么广泛。
嘭！路卡利欧的骨棒砸在真嗣右手的波导防护罩上，眼神居然恢复清明了一瞬间，随即继续痛苦的哀嚎起来。
“路卡利欧！”小智和小刚一左一右把路卡利欧控制了起来。
另一边，枪之柱发射出的能量光柱，横跨半个神奥大陆，直击天冠山！
“这到底是怎么回事。！”天冠山议会，希罗娜和四天王面色严肃的看着这道光柱。
神奥的众议员也纷纷惊恐的看着天空。
“哼，这就是天灾，老天都觉得神奥应该变天了！”兹拜因巴哈拄着拐杖，阴阳怪气的说着屁话。
“对对对，赶紧让达克多少爷接任冠军吧。”
“是啊是啊……”
百分之七十的议员都拍马屁似的跟在兹拜因巴哈的屁股后面，只有乔伊君莎几个大族，不屑的看着那些墙头草。
“监测到天冠山有能量流动，现在也持续流动中！”芥子兰博士的研究所，山梨博士的研究所同时发出报警。
不光如此，真嗣的家乡，帷幕市的陨石坑，也升腾起无数的蓝色光柱，直冲云霄！
钢铁岛遗迹中，班纳伊面色难看的看着眼前的两幅壁画，帕路奇犽和帝牙卢卡的壁画不断闪烁着蓝色光芒。
“这下糟糕了，我现在汇报给篝火部长请求支援来不来得及啊……”
阿驯满脸懵逼：“到底发生什么事了。”
伙星看着眼前的景象轻松的接通联络：“总部，这里是G2，目前正在把高能量光束向目的地持续照射中。”
“了解～”耳机传来回应。
“赤日大人，光束果然射向天冠山了。然后也感测到天冠山发出与钢铁岛相同的高能量反应。
我想枪柱应该就会在这能量分布区的范围里面。现在正在检测更为正确的位置。”银河队总部，镇星恭敬的向赤日汇报道。
“继续维持照射，寻找枪之柱的准确位置。让伙星原地待命。”赤日沉声道。
“哼～真是大闹了一场啊。”黑色西装的坂木老人揣着兜走进会议室。
“坂木……在我实现伟大理想之前，你最好不要招惹我，我也会按照约定，把改变世界的资本留给你。”赤日紧紧的盯着坂木。
“哼，放心吧，我还没那么蠢，做一些两败俱伤的事情。”坂木把玩着手里的高级球，那是火箭队从神奥各地收服的三神柱。
视线回到真嗣一行人面前，为了阻止路卡利欧暴走，亚玄拜托小智对路卡利欧使用十万伏特。
皮卡丘毫不犹豫，连带着控制路卡利欧的小智小刚一起，一发十万伏特劈了上去……
小智和小刚吃痛脱手，路卡利欧恢复了一定的神智，拼了命向矿坑底部跑去。
“路卡利欧，追！”小智大喊一声，众人紧跟着路卡利欧冲下了矿坑。
路卡利欧一路直奔银河队的器械，但是还没靠近，就被银河队的神奇宝贝击倒在地，只有伸着手，倔强的看着眼前的机械。
“路卡利欧！”小智几人惊呼。
“亚玄先生，我们快去救它！”小智着急的喊道。
“别着急！”真嗣瞪了小智洗一眼：“看清楚情况再行动，先把那台机器破坏掉！就是它在折磨路卡利欧和其他钢系宝可梦！”
“没错。”亚玄点点头。：“路卡利欧那么在意那台机器，值得一试！”
“好！冲吧！”小智说完，众人便一跃而起，打算跳过地面的大坑，去捣毁机器。
没想到就是这么简单的一个动作，波加曼还给搞出了乌龙。小短腿一路助跑跳上坑洞的上方，然后……直接掉了下去～
小光都忍不住捂脸：“波加曼……”
洞里吧阿驯一脸懵逼，这咋天上还下波加曼呢……
“诶，阿驯？”小光看向洞口，马上发现了里面的两个冤种。
“各位我找到阿驯了。”小光喊道。
“诶？”众人回头。
“好，我马上过来！”小智立刻回头。
“不用，这里没问题的，你们先走吧。”小光认真的点头。
“就拜托你咯！”小智点点头，众人回头就走。
轰隆……没想到几人刚回头，小光就被一只发狂的大钢蛇也给怼进了洞里。
不光如此，发狂的大钢蛇还准备冲进去攻击几人。
“救命啊领导！”班纳伊的哀嚎传了出来。
真嗣嘴角抽搐，：“亚玄，你的神奇宝贝不适合战斗，我去捣毁机器你和小智他们去救人！”
“可以吗？”亚玄犹豫的问道。
嘭！翠绿的神龙腾空而起，真嗣站在烈空座头顶双手抱胸：“我可是正牌的神兽使。”
“知道了，拜托你了真嗣！”小智和小刚激动的点点头。
“烈空座！走吧！”真嗣一挥手，烈空座盘旋上升，向着矿坑底部的飞去。
伙星突然感觉天空一暗，抬起头，瞬间面色惨白：“烈……烈空座……！我尼玛裂开了啊！！”
“烈空座，用龙星群！”真嗣居高临下，冷冷的命令道。
“额唔！！！”烈空座抬起头颅，一发巨大的宛如小太阳一般的陨石飞射入高空，随后，漫天的陨石包裹着炽热的龙炎从天而降！
知道什么叫覆盖式轰炸吗？这就是！
伙星绝望的看着天空，无数的大嘴蝠也只不过是阻挡了一瞬间，立刻就被龙星群的陨石吞没殆尽。
整片大地宛如被陨石雨洗礼，一片狼藉，四处烽火……
轰隆～困扰了岛上钢系宝可梦这么多天的装置，直接在陨石下化成了碎片。
“喂，下面的银河队，给你们一分钟，从这里滚出去，记住了，你们不想要这个世界，那么我也不会在意你们的生命，一分钟是我给你们唯一的仁慈。”真嗣眼神冰冷，语气冷漠。
“可恶！”伙星不敢赌真嗣说的是真是假。转过头带着还能行动的银河队员疯狂逃窜进早就准备好的直升机。
几乎是用上了吃奶的力气，直升机一瞬间消失在天际。
“G2报告，之前出现的2号人物，请把危险等级提升到特一级！行动失败，装置已经被破坏了。”伙星报告道。
“什么？那你们走之前为什么不把遗迹爆破掉？”镇星不满的回复。
“我爆破尼玛！”伙星罕见的发火了：“那个疯子骑着烈空座来的，一分钟之内不跑，他就会对我们大开杀戒！有能耐你去爆破，艹！”
镇星：……
坂木和赤日：……这小子挺狠啊……
“算了，人没事就好。”赤日无奈的摇了摇头。枪柱的扫描工作只完成了百分之六十，剩下的百分之四十，就只能靠银河队的两条腿，覆盖式的寻找了。反正就在天冠上上，也不怕枪之柱找不到。
“哼，那个小子越来越强了，不过想对付他，也不一定要打。”坂木笑了笑，就在刚才，真嗣骑着烈空座大开杀戒的画面已经被坂木的特工拍下了画面传了回来。
只要稍微恶意剪辑一下……哼哼……
钢铁岛，伴随着银河队的撤离，骚动总算告一段落。
岛上的神奇宝贝们也纷纷恢复正常。
遗迹里的班纳伊和阿驯也被救了上来。真嗣饶有兴趣的看着班纳伊：“啧啧，真丢人，回去好好训练几只神奇宝贝吧，”
“咳咳，属下告退。”班纳伊一分钟都不想多待，转头就跑了。丢人都丢到真嗣这里了，以后的仕途堪忧啊。
众人休整了一会，便听见直升机的声音，芥子兰博士收到真嗣的讯息，风风火火的便赶了过来。
“芥子兰奶奶～”真嗣迎上去。
“做的不错。”芥子兰博士点点头看向坑洞的下方。：“所以，这里就是？”
“没错，钢铁遗迹。”真嗣点点头。
“马上通知研究所的人，把发掘设备全部运过来。立刻设立保护线和研究所分部。”芥子兰博士激动的吩咐道。
“是！”随行的研究员立刻去一边打电话去了。
“好啊～好啊～”芥子兰博士满意的点点头。
“奶奶，亚玄先生世代居住这里，发掘工作也许他能帮到你。”真嗣介绍道。
“哦～那就真的要麻烦亚玄先生了。”芥子兰看向亚玄。
“不用客气，老实说我也更想了解这座岛了。”亚玄点点头。
一场动乱结束了，真嗣一行人与阿驯在港口分别，阿驯也好，亚玄也好。和不同的神奇宝贝训练家相遇和分别，都会铭记在心。
真嗣一行人搭上了前往木通镇的船，然而，银河队的野心正在动摇着原本安静祥和的神奥地方……